队伍搭配的核心在于属性平衡与技能互补。初始选择小火龙、杰尼龟或妙蛙种子会直接影响前期阵容构建，建议根据后续捕捉计划调整。火系推荐搭配风速狗或喷火龙，水系优选暴鲤龙或宝石海星，草系则可考虑妙蛙花或椰蛋树。电系必备雷丘或三圣鸟之一的闪电鸟，超能系胡地或宝石海星能有效应对格斗与毒系敌人，而岩石/地面系隆隆岩或铁甲暴龙可增强防御。
暴鲤龙的龙舞强化配合水系攻击能快速清场，胡地的精神干扰可压制格斗系道馆，而闪电鸟的十万伏特对飞行与水系有显著克制。岩石系技能如岩崩能针对火系与飞行系敌人，地面系地震则能反制电系。注意携带变化类技能如催眠粉或电磁波控制战场节奏，同时确保队伍中有至少一只宝可梦掌握冲浪、飞翔等秘传技能以方便地图探索。
恶系天王建议用格斗系快泳蛙或虫系飞天螳螂应对，冰系乘龙或铁甲贝能压制龙系天王，超能系胡地可对抗毒系敌人。冠军小茂的水箭龟需依赖电系或草系宝可梦快速解决，其化石翼龙则需用水系或岩石系技能克制。神兽如急冻鸟、火焰鸟可根据空缺属性选择性收服，但需注意其等级成长较慢，需提前规划培养。
最终成型的理想队伍应包含2-3只主攻手、1-2只防御型宝可梦及1只辅助单位。例如喷火龙（火/飞行）、宝石海星（水/超能）、隆隆岩（岩石/地面）、雷丘（电）、胡地（超能）与快龙（龙/飞行）的组合能覆盖绝大多数战斗场景。若追求极限输出，可将防御位替换为三圣鸟或卡比兽。注意避免属性重复，并确保每只宝可梦至少掌握一项本系高威力技能。
养成过程中需合理分配努力值，攻击型宝可梦优先提升速度与输出属性，坦克型则侧重HP与防御。利用一号岛灯火山或冠军之路等地点集中刷级，配合幸运蛋加速经验获取。隐藏道具如剩饭、焦点镜片可进一步提升战斗效率，但需通过剧情探索或NPC交换获取。
